Początki dzisiejszej stacji Dębica Towarowa sięgają roku 1890. Wtedy to zapadła decyzja o lokalizacji stacji ładunkowej (Ladestation) o nazwie Pustynia w km. 3,040 linii Dębica - Rozwadów. Dalsze losy tej ładowni praktycznie są nieznane. Nie wykazują jej żadne oficjalne dokumenty i mapy, zarówno austriackie jak i polskie. Jej reaktywacja nastąpiła dopiero w roku 1943. Niemcy urządzili w tym miejscu stację towarową (dokładnie w km. 2,097), która po roku 1945 funkcjonowała jako grupa torów pod nazwą: Centralny Zarząd Przemysłu Metali Nieżelaznych. Nie wykluczone, że była to nazwa bocznicy, która w tym miejscu brała swój początek. Powrót do nazwy Pustynia zdradza służbowy rozkład jazdy z roku 1956, natomiast Dębica Towarowa pojawia się w roku 1959.